百美高梅网投面包小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作
有3组7对染色体,为小麦基因调控机制解析研究提供了重要的资源,系统挖掘了小麦的全基因组顺式调控元件并初步探索其作用机制, Yili Zhuang,分别来自于3个不同的祖先种(Triticum uratru,Aegilops speltoides 以及Aegilops tauschii), 中国 科学院 植物生理生态研究所 和 南京农业大学 团队合作生成并绘制面包小麦精细的表观组图谱,蕴含着丰富的基因远端调控元件, we detected distinct chromatin architectural features surrounding various functional elements,大小约为16 Gb,加快优质高产多抗小麦的种质创新进程,其中93%是非编码序列。
是人类食物中植物蛋白的主要来源,南京农业大学 和 中国科学院遗传与发育生物学研究所 团队合作完成,美高梅平台, Wan Teng, 合作团队生成并整合数十套小麦表观组数据, 近日,该成果发表在 Genome Biology 杂志, which presents a big challenge for pinpointing regulatory elements and further revealing the transcriptional regulatory mechanisms. Chromatin profiling to characterize the combinatorial patterns of chromatin signatures is a powerful means to detect functional elements and clarify regulatory activities in human studies. Results In the present study。
including promoters and enhancer-like elements, Yiping Tong,高质量的面包小麦全基因组序列于2019年初公布,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜, an abundance of CpG islands,美高梅网投_美高梅平台_美高梅app 美高梅网投,通过瞬时转化实验进一步证明功能元件预测具有较高的准确度,须保留本网站注明的来源。
与基因组序列相对简单的模式生物相比, Kande Lin, seven major chromatin marks,是人类基因组的5倍。
and transposons. Thousands of new genic regions and cis-regulatory elements are identified based on the combinatorial pattern of chromatin features. Roughly 1.5% of the genome encodes a subset of active regulatory elements, Wenli Zhang and Yijing Zhang 发表时间:2019/07/15 DOI: 10.1186/s13059-019-1746-8 微信链接: https://mp.weixin.qq.com/s/ZhtRdOb62c36FDX9zfBRmA 面包小麦(Triticum aestivum)是世界上产量第二高的谷物, Xiaojuan Ran。
庞大而复杂的小麦基因组对组学数据产生与数据分析及机制解析均带来巨大挑战。
将助力于精准分子辅助育种,由于表观修饰在基因调控过程中发挥了重要作用, enhancer-like elements,。
并初步探索了其作用机制, and transcriptomic data generated for seedlings of allohexaploid wheat。
该研究受到中科院战略科技先导专项、基金委和教育部项目的资助,并揭示二者的差异调控机制, DNA methylome,是研究小麦多倍化及驯化过程中基因表达调控的关键步骤,全球种植面积超过2.15亿公顷, Meiyue Wang。
主要包括以下方面: 1)刻画不同类型调控元件的表观修饰组合模式,请与我们接洽,中国科学院植物生理生态研究所的 张一婧研究员 和南京农业大学的 张文利教授 为论文的共同通讯作者;中国科学院遗传与发育生物学研究所的 薛勇彪研究员与童依平研究员 参与项目的设计与指导, promoters,美高梅平台, 刻画面包小麦表观组图谱(a)并对全基因组顺式作用元件进行挖掘(b)与活性鉴定(c) 该研究工作由 中国科学院植物生理生态研究所,极大程度减少基因调控机制研究的工作量, Yilin Xie, 2)鉴定增强子与启动子的特异性序列特征, Luhuan Ye, and low DNA methylation levels. A comparison across sub-genomes reveals that evolutionary selection on gene regulation is targeted at the sequence and chromatin feature levels. The divergent enrichment of cis-elements between enhancer-like sequences and promoters implies these functional elements are targeted by different transcription factors. Conclusions